シングルセル解析プラットフォーム
10×GENOMICS Chromium コントローラー
設置 : 2021年3月
※2025年12月31日をもって主要キットの販売が終了します。
販売終了のお知らせ：Chromium Next GEMシングルセル製品
Chromiumコントローラーについて
利用形態
貸出し期間
利用対象者
費用
利用の流れ
＜申込方法＞
＜支援センターで貸し出し可能な周辺機器＞
＜支援センター設置機器＞
注意事項
トラブルシューティング
Chromiumコントローラーについて
NGSライブラリーを作成するためのシングルセル解析プラットフォーム。
マイクロ流路を用いたエマルジョン作成技術と分子バーコード（細胞バーコード）を組み合わせることで、ハイスループットなシングルセル解析が可能。
利用形態： 貸出し- 各研究室で、必要なキット・試薬・消耗品をご準備いただき、Chromiumコントローラーを使用したサンプル調製を行っていただきます。キット・試薬類は非常に高額です（100万円～）。実験内容を10×Genomic社担当者様および支援センタースタッフと打ち合わせした後に購入してください。
- https://www.scrum-net.co.jp/product/list/singlecell-ngs/chromium/reagents-consumables
- ※次世代シーケンシングおよびデータ解析のサポートは行っておりません。
貸出し期間： 実験日（最大3日間）＋装置の移送日- 機器予約システムで予約していただきます。
利用対象者： 利用登録申請済みで、下記の利用条件①～④を完了した方（学内限定）- ～利用条件～
①テクニカルセミナー（録画）の視聴（対象者に視聴サイトをご案内します。）
②試薬購入前に10×Genomics社担当者様との打ち合わせ
③支援センタースタッフとの貸出しについての打ち合わせ
④貸出しまでにHow-to videoの視聴による実験手順の確認。
下記よりご使用されたキットに対応するVideoをご視聴ください。
https://www.10xgenomics.com/jp/support
主なキットのHow-to video
・Chromium Next GEM Single Cell 3' v3.1 - Dual Index
https://pages.10xgenomics.com/sup-how-to-single-cell-gene-expression-v3.1-dual-index.html
・Chromium Next GEM Single Cell 5' v2 Dual Index
https://pages.10xgenomics.com/sup-how-to-single-cell-5-v2-dual-index.html
費用: 50,000円/回- 貸出し後は、使用の有無にかかわらず費用が発生しますことをご了承ください。
- 申込書に基づき、月末締めで、毎月医系学部等財務課経理第一係より、予算の振替処理をいたします。
部局等運営経費・科学研究費補助金・受託研究費・共同研究費・寄附金等からのお支払になります。
利用の流れ- ＜申込方法＞
１．支援センターへの連絡
内線：6602（馬出キャンパス以外91-6602）
メール：
以下を確認します。
(１) 実験内容
(２) 実験日程
(３) 利用条件①～④の説明
↓
２．利用条件①～④の実施
キットの注文・必要試薬や周辺機器の準備（キットの納入に１ヶ月程度かかります）
ウェブ予約
※実験日が決まったらお早目に支援センターにメールまたは内線でご連絡の上、ウェブ予約をしてください。
↓
３．申込書の提出
場所：教育・研究支援センター（馬出地区医学研究院基礎研究A棟2階西側）
URL: http://www.supportcenter.med.kyushu-u.ac.jp/access.html
受付日時：月曜日～金曜日（祝日は除く）11：00～12:00、13：00～15：00
申請書はこちら
↓
４．機器の貸出し
※Chromium機器のコントローラーの輸送（設置と梱包を含む）は正晃株式会社の方にご協力いただきます。
＜支援センターで貸出し可能な周辺機器＞
①PCR装置（Eppendorf社 Mastercycler X50s）
②卓上型遠心機ぷちはち（８連チューブ遠心用）
③ボルテックス（Vortex Genie 2）
＜支援センター設置機器＞
4150Tape Station
※試薬・消耗品は各自でご購入いただきます。
※事前に講習が必要です。
※機器予約システムでの予約が必要な装置です。
注意事項：- Chromiumコントローラーと周辺機器①PCR装置の開梱や梱包は、代理店の担当の方にご協力いただきますが、利用者が必ず立ち会うようにしてください。
- Chromiumコントローラーは、振動を与える機器から30㎝以上離した場所に設置してください。
（特にVortexとは同じテーブルに載せないでください。） - Chromiumコントローラーは高額な装置です。取り扱いには細心の注意を払い、装置を傾けたり衝撃を与えたりしないでください。
- 周辺機器①PCR装置は消費電力が850Wの機器であるため、必ずコンセントを単独でご使用ください。
- 利用者の不注意による故障が明らかな場合は、修理費用を所属分野でご負担いただきます。
トラブルシューティング：- テストチップでのテストランの不具合
Gasketエラー → Gasketに埃や傷がないか確認し再度実施
→ アクセサリーキットの予備のGasketと交換 → 再度実施
その他のエラー → USBメモリを挿し、エラー番号を保存 →「トラブル時の連絡先」に連絡 - 装置の不具合 → プロトコールのトラブルシューティングに従う → 改善しない場合は「トラブル時の連絡先」に連絡
- GEMs（シングルセル液滴）の形成不良の発生 → 写真を撮り、プロトコールのトラブルシューティングに従う
※GEMsの形成の良し悪しに関わらず、必ず写真を撮ってください。
GEMsの形成不良時の試薬補填の手続きは、各自で行っていただきます。
～キットの補填に必要なもの～
・使用したチップキットとライブラリー＆ゲルビーズキットのロット番号（使用期限内のもの）
・GEMs形成不良を示す写真（チューブ内の様子が見えるように、背景は黒などの濃い色）
※解決したトラブルであっても、必ず支援センターに報告してください。
「Chromiumコントローラー返却時チェックリスト」にも必ず詳細をご記載ください。
＜トラブル時の連絡先＞
・10×Genomics社 松山様
TEL：090-7809-8278 メール：haruyo.matsuyama@10xgenomics.com
担当者とつながらない場合には、以下の連絡先までお問い合わせください。
・株式会社スクラム メール：10xgenomics@scrum-net.co.jp
・10×Genomics社テクニカルサポート メール：support@10xgenomics.com
＜トラブルの報告先＞
・医学研究院附属教育・研究支援センター
TEL：092-642-6602 メール：
＜代理店＞
・正晃株式会社
TEL：092-611-8131 メール：fukuoka1@seikonet.jp
※上記すべてについて
電話対応可能時間帯：平日9:00～17:00
（コロナウィルス感染拡大の状況により、変更する場合があります）
